Sarem Journal of Medical Research
مجله تحقيقات پزشكي صارم
SJMR
Medical Sciences
http://saremjrm.com
1
admin
2251-8215
2476-3470
10.52547/sjrm
2476-3470
fa
jalali
1399
3
1
gregorian
2020
6
1
5
1
online
1
fulltext
fa
نقش تکنیکهای ژنتیک مولکولی در تشخیص COVID-19
The role of molecular genetic techniques in COVID-19 diagnosis
اختلالات ژنتيک ناباروری
Sterility Genetical Disorders
مروری تحلیلی
Analytical Review
<span dir="LTR"></span><strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:11.0pt;">زمینه ها و اهداف:</span></span> </strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">ما با اپیدمی­های مکرری از ویروس­ها همانند کرونا ویروس­های عامل سندرم­های تنفسی خاورمیانه، 2009، ویروس ایبولا، ویروس زیکا و ویروس اخیر یعنی </span></span><span style="font-family:Times New Roman;"><span style="font-size:11px;"><span dir="LTR">COVID-19</span> </span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">رو به رو بوده ایم. همه­ی این اپیدمی­ها در اثر انتقال از یک حیوان به انسان رخ داده اند که به صورت محسوس یا غیر محسوس در جمعیت انسانی منتقل شده­اند و</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">در زمان وجود هریک از این اپیدمی­ها عدم وجود یک روش تشخیص مولکولی سریع و در دسترس، سلامت عمومی را با خطر مواجه کرده است.</span></span><br>
<span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">بیشتر آزمایشات برای تشخیص زودرس </span></span><span style="font-size:11px;"><span style="font-family:Times New Roman;"><span dir="LTR">SARS-CoV-2</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> به واکنش زنجیره ای پلیمراز معکوس (</span></span><span style="font-size:11px;"><span style="font-family:Times New Roman;"><span dir="LTR">Reverse transcription polymerase</span> <span dir="LTR">chain</span> <span dir="LTR">reaction</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">) تکیه دارد، اما تستهای بر پایه ی تکثیر ایزوترمال و روش های مبتنی بر </span></span><span style="font-size:11px;"><span style="font-family:Times New Roman;"><span dir="LTR">CRISPR</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">، گزینه های امیدوار کننده ای هستند. شناسایی افرادی که آنتی بادی های انها علیه ویروس</span></span><span style="font-size:11px;"><span style="font-family:Times New Roman;"><span dir="LTR">SARS-CoV-2</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"><span style="font-size:11px;"><span style="font-family:Times New Roman;"> </span></span>فعال شده است، نیاز به آزمایش های سرولوژیکی دارند، از جمله سنجش ایمونوسوربنت مرتبط با آنزیم (</span></span><span style="font-size:11px;"><span style="font-family:Times New Roman;"><span dir="LTR">ELISA</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">) و روش ایمنی سنجی جانبی و این تست ها می توانند تست های مکمل در موارد پیچیده بیماری باشند. این مقاله به بررسی تکنیک های تشخیصی ژنتیک مولکولی </span></span><span style="font-family:Times New Roman;"><span style="font-size:11px;"><span dir="LTR">COVID-19</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"><span style="font-family:Times New Roman;"><span style="font-size:11px;"> </span></span> می پردازد.</span></span><br>
<br>
<strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:11.0pt;">نتیجهگیری:</span></span> </strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">ر</span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">قابت بر سر توسعه ی تکنیکهای آزمایشگاهی کارآمد و مقرون به صرفه و دقیق که قابلیت استفاده در مقیاس های بزرگ را داشته باشند، همچنان ادامه دارد. اگرچه تکنیک</span></span><span style="font-family:Times New Roman;"><span style="font-size:11px;"><span dir="LTR">RT</span><span dir="LTR">-</span><span dir="LTR">PCR</span></span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> یک تکنیک غالب برای شناسایی </span></span><span style="font-size:11px;"><span style="font-family:Times New Roman;"><span dir="LTR">RNA</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"><span style="font-size:11px;"><span style="font-family:Times New Roman;"> </span></span>ویروسی است، سایر تستهای نوکلئیک اسیدی از قیبل تستهای تکثیر ایزوترمال، هیبریدیزاسیون ریز آرایه، تعیین توالی متاژنومیک بر پایه امپلیکون و اخیرا تکنیکهای بر پایه کریسپر نیز در حال توسعه و تکامل هستند.</span></span>
<strong>Background and aims:</strong> We have encountered many epidemics such as HIV, SARS and Middle East respiratory syndrome corona viruses, Ebola virus, Zika and recently SARS-Cov-2. All these epidemics resulted from an animal to human transmission, during all these epidemics, absence of rapid and accurate molecular diagnostic testing has threatened the public health. Most tests for early detection of SARS-COV-2 RNA rely on reverse transcription-polymerase chain reaction, but isothermal mediated amplification assays and CRISPER based methods are thriving alternatives. Identification of individuals who have activated antibodies to the SARS COV-2 virus requires serological tests including enzyme-linked immuno sorbent assay (ELISA) and lateral flow immunoassay and they can be used as complementary tests in complex cases. This report is an overview of current development in COVID 19 molecular genetic techniques and future improvement and innovation. <br>
<strong>Conclusion:</strong> There is an ongoing race to develop more efficient laboratory techniques and cost-effective, point-of-care test kits that can be used in large scale. While RT-PCR has been the dominant technique for detection of viral RNA, other nucleic acid assays such as isothermal amplification assays, hybridization microarray assays, amplicon-based metagenomics sequencing, and recently CRISPR-related technologies are also under development.
COVID-19, RT-PCR, کریسپر, تکثیر ایزوترمال
COVID-19,RT-PCR,CRISPER,Isothermal amplification
1
9
http://saremjrm.com/browse.php?a_code=A-10-283-3&slc_lang=fa&sid=1
Leila
Javanparast Sheikhani
لیلا
جوانپرست شیخانی
Leila.javanparast@gmail.com
10031947532846003651
10031947532846003651
No
Sarem Fertility and Infertility Research Center (SAFIR), Sarem Women’s Hospital, Iran University of Medical Sciences (IUMS), Tehran, Iran
مرکز تحقیقات باروری و ناباروری صارم، بیمارستان فوق تخصصی صارم، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران
Sara
Taghizadeh
سارا
تقی زاده
10031947532846003652
10031947532846003652
No
Sarem Fertility and Infertility Research Center (SAFIR), Sarem Women’s Hospital, Iran University of Medical Sciences (IUMS), Tehran, Iran
مرکز تحقیقات باروری و ناباروری صارم، بیمارستان فوق تخصصی صارم، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران
Tamouchin
Moharrami
تموچین
محرمی
tamochinmoh@gmail.com
10031947532846003653
10031947532846003653
No
Sarem Fertility and Infertility Research Center (SAFIR), Sarem Women’s Hospital, Iran University of Medical Sciences (IUMS), Tehran, Iran
مرکز تحقیقات باروری و ناباروری صارم، بیمارستان فوق تخصصی صارم، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران
Golnoosh
Goljah Rad
گلنوش
گلجاه راد
golnooshrad1366@yahoo.com
10031947532846003654
10031947532846003654
No
Sarem Fertility and Infertility Research Center (SAFIR), Sarem Women’s Hospital, Iran University of Medical Sciences (IUMS), Tehran, Iran
مرکز تحقیقات باروری و ناباروری صارم، بیمارستان فوق تخصصی صارم، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران
Aleme
Mohammadpour
عالمه
محمدپور
alememohamadpoor@gmail.com
10031947532846003655
10031947532846003655
No
Sarem Fertility and Infertility Research Center (SAFIR), Sarem Women’s Hospital, Iran University of Medical Sciences (IUMS), Tehran, Iran
مرکز تحقیقات باروری و ناباروری صارم، بیمارستان فوق تخصصی صارم، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران
Farkhondeh
Behjati
فرخنده
بهجتی
fbehjati@gmail.com
10031947532846003656
10031947532846003656
Yes
Sarem Fertility and Infertility Research Center (SAFIR), Sarem Women’s Hospital, Iran University of Medical Sciences (IUMS), Tehran, Iran & Genetics Research Centre, University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences, Tehran, Iran.
مرکز تحقیقات باروری و ناباروری صارم، بیمارستان فوق تخصصی صارم، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران و مرکز تحقیقات ژنتیک، دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی، تهران، ایران